Der Bestand ist thematisch in folgende Gruppen eingeteilt:

• Allgemeine Theorie
• Übergreifendes, Vergleichendes zum Dritten Sektor
• Ehrenamt, Freiwilligenarbeit, Selbsthilfe
• Management, Fundraising
• Dritter Sektor und Staat
• Dritter Sektor und Wirtschaft
• Dritter Sektor und Private Haushalte
• Kultur, Kunst, Freizeit
• Schule, Hochschule, Bildung, Forschung
• Gesundheit
• Soziale Dienste
• Umwelt- und Naturschutz
• Binnenentwicklungsförderung
• Rechts- und Interessenvertretung, Politik
• Internationale Entwicklung, Völkerverständigung
• Kirchen, Religion
• Berufs- und Wirtschaftsverbände 
• Sonstige Tätigkeitsfelder
• Allgemeine Hilfsmittel

Der Bundesverband Deutscher Stiftungen sammelt seit 1948 Akten und vielfältige Dokumente aus dem Stiftungswesen, darunter Korrespondenzen namhafter zeitgeschichtlicher Persönlichkeiten. Die Materialien sollen zu einem Stiftungsarchiv aufgearbeitet werden. 
Mit der Stiftungsbibliothek, dem Stiftungsverzeichnis und zukünftig dem Stiftungsarchiv bietet das Haus Deutscher Stiftungen allen am Stiftungswesen Interessierten ein umfassendes Dokumentationszentrum.